Etnologia: 

Culturas e línguas indígenas do Brasil (1957);
Arte plumária dos índios Kaapo (1957);
A política indigenista brasileira (1962);
Os índios e a civilização (1970);
Uira sai, à procura de Deus (1974);
Configurações histórico-culturais dos povos americanos (1975);
Suma etnológica brasileira, em colaboração com Berta G. Ribeiro (1986, 3 vols.).

Antropologia da civilização: 

O processo civilizatório - Etapas da evolução sócio-cultural (1978);
As Américas e a civilização - Processo de formação e causas do desenvolvimento cultural desigual dos povos americanos (1970);
O dilema da América Latina - Estruturas do poder e forças insurgentes (1978);
Os brasileiros - 1. Teoria do Brasil (1972);
Os índios e a civilização - A integração das populações indígenas no Brasil moderno (1970);
The Culture - Historical Configurations of the American Peoples (1970;
edição brasileira, (1975);
O povo brasileiro - A formação e o sentido do Brasil (1995).

Romance: 

Maíra (1976);
O mulo (1981);
Utopia selvagem (1982);
Migo (1988).

Ensaios: 

Kadiwéu - Ensaios etnológicos sobre o saber, o azar e a beleza (1950);
Configurações histórico-culturais dos povos americanos (1975);
Sobre o óbvio - Ensaios insólitos (1979);
Aos trancos e barrancos - Como o Brasil deu no que deu (1985);
América Latina: a pátria grande (1986);
Testemunho (1990);
A fundação do Brasil - 1500/1700 - em colaboração com Carlos Araújo Moreira Neto (1992);
O Brasil como problema (1995);
Noções de coisas. Com ilustrações de Ziraldo (1995).

Educação: 

Plano orientador da Universidade de Brasília (1962);
A Universidade necessária (1969);
Propuestas - Acerca da la Renovación (1970);
Université des Sciences Humaines d'Alger (1972);
La Universidad peruana (1974);
UnB - Invenção e descaminho (1978);
Nossa escola é uma calamidade (1984);
Universidade do terceiro milênio - Plano orientador da Universidade Estadual do Norte Fluminense (1993). Suas obras foram traduzidas para o inglês, o alemão, o espanhol, o francês, o italiano, o hebraico, o húngaro e o tcheco.