A Coleção Afrânio Peixoto foi assim nomeada por decisão unânime da Academia, em 1931, para homenagear seu idealizador e dinâmico realizador. Considerada a primeira Coleção das publicações acadêmicas, essa coleção se formou a partir das obras que saíram como Biblioteca de Cultura Nacional.
A publicação das demais séries da Coleção Afrânio Peixoto interrompeu-se em 1961, com as Obras de João Ribeiro, Crítica, volumes V e VI. Porém em 1986, o Presidente Austregésilo de Athayde determinou à Comissão de Publicações a continuação da Coleção Afrânio Peixoto, inaugurando a nova fase com João Francisco Lisboa - O Timon Maranhense.
Obras
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O Ocaso do Império
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Antologia da Revista da Academia Brasileira de Letras
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Hóspede; Lar
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Cem anos de cultura brasileira - Ciclo de conferências / Iº Centenário da ABL
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Correspondência de Machado de Assis: Tomo II, 1870-1889.
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Franklin Távora e o Seu Tempo
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Cartas de Erasmo
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A Desejada Fé
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Discursos Acadêmicos de Josué Montello